Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal2bQ9D1Y9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Shisal2bQ9D1Y9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shisal2bQ9D1Y9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms