Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snu13Q9D0T1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snu13Q9D0T1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms