Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdhd3Q9CYW4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdhd3Q9CYW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms