Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrps28Q9CY16 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrps28Q9CY16 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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