Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PmpcbQ9CXT8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmpcbQ9CXT8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PmpcbQ9CXT8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms