Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms