Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4931417E11RikQ9CR05 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms