Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr3kQ9CQZ7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr3kQ9CQZ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms