Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl11Q9CQF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl11Q9CQF0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl11Q9CQF0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms