Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA0

Cenpm, Centromere protein M, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpmQ9CQA0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CenpmQ9CQA0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CenpmQ9CQA0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms