Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prpf8Q99PV0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf8Q99PV0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms