Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NsmfQ99NF2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NsmfQ99NF2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184 ms