Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rims1Q99NE5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rims1Q99NE5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms