Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR9

Ppp1r3a, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3aQ99MR9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp1r3aQ99MR9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3aQ99MR9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r3aQ99MR9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r3aQ99MR9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r3aQ99MR9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms