Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncaipQ99ME3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SncaipQ99ME3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SncaipQ99ME3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SncaipQ99ME3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SncaipQ99ME3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SncaipQ99ME3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SncaipQ99ME3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SncaipQ99ME3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SncaipQ99ME3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SncaipQ99ME3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SncaipQ99ME3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms