Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins4Q99LZ3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins4Q99LZ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms