Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed9Q99KF1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed9Q99KF1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms