Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1bQ99JY6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms