Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlcd1Q99JT6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlcd1Q99JT6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlcd1Q99JT6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms