Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd6Q99JI4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmd6Q99JI4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmd6Q99JI4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms