Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddb2Q99J79 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms