Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrcc4Q924T3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Xrcc4Q924T3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms