Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubb6Q922F4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms