Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc1bQ920F6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smc1bQ920F6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc1bQ920F6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms