Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf6Q91YR7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prpf6Q91YR7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf6Q91YR7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms