Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps3Q91VB4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms