Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt79Q8VED5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms