Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3I3

Cog6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog6Q8R3I3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog6Q8R3I3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Cog6Q8R3I3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog6Q8R3I3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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