Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z0

Nod2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nod2Q8K3Z0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nod2Q8K3Z0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nod2Q8K3Z0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nod2Q8K3Z0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 375.8 ms