Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl47Q8K2Y7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl47Q8K2Y7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms