Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc3Q8CFZ4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpc3Q8CFZ4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms