Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Cc2d2aQ8CFW7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cc2d2aQ8CFW7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2aQ8CFW7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cc2d2aQ8CFW7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms