Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ercc8Q8CFD5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc8Q8CFD5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms