Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Riox2Q8CD15 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riox2Q8CD15 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms