Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrn3Q8CBC6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn3Q8CBC6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms