Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A430089I19RikQ8C9W1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
A430089I19RikQ8C9W1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms