Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp20Q8C6M1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp20Q8C6M1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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