Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVQ5

Ppme1, Protein phosphatase methylesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppme1Q8BVQ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppme1Q8BVQ5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppme1Q8BVQ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppme1Q8BVQ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms