Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AtripQ8BMG1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AtripQ8BMG1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms