Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd4aQ8BIE6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmd4aQ8BIE6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms