Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gabra5Q8BHJ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms