Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.4Q85ZW8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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H2-M10.4Q85ZW8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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H2-M10.4Q85ZW8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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H2-M10.4Q85ZW8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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H2-M10.4Q85ZW8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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H2-M10.4Q85ZW8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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H2-M10.4Q85ZW8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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