Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2eQ80UW8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2eQ80UW8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2eQ80UW8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms