Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sestd1Q80UK0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sestd1Q80UK0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sestd1Q80UK0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms