Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno2Q7TNB8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno2Q7TNB8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno2Q7TNB8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms