Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScocQ78YZ6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScocQ78YZ6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms