Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GypcQ78HU7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GypcQ78HU7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GypcQ78HU7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GypcQ78HU7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GypcQ78HU7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GypcQ78HU7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GypcQ78HU7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GypcQ78HU7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms