Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2r2Q6ZWZ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2r2Q6ZWZ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms