Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube2oQ6ZPJ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms