Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Casc1Q6TDU8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casc1Q6TDU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms